L'AJMQ a pour objectif de représenter toute la jeunesse médicale québécoise.
Seul syndicat professionnel à adhésion volontaire, comptant près de 1000 membres.
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L’AJMQ fut fondée en 1995 suite à une série de clauses abusives et discriminatoires contre les jeunes médecins du Québec dans les ententes collectives entre les fédérations médicales et le gouvernement.